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Tipo: Trabalho de Conclusão de Curso
Título: IDENTIFICAÇÃO E DESENVOLVIMENTO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES CANDIDATOS PARA Brosimum gaudichaudii Trécul.: UMA ESPÉCIE MEDICINAL E NATIVA DO CERRADO
Autor(es): Marcelo, Isadora
Primeiro Orientador: Silveira, Ricardo
Primeiro Coorientador: Menezes, Ivandilson
Primeiro Membro da Banca: Silveira, Ricardo
Segundo Membro da Banca: Menezes, Ivandilson
Terceiro Membro da Banca: Freitas, Marco Antônio
Resumo: A espécie Brosimum gaudichaudii é pertencente à família Moraceae e apresenta ampla distribuição no Cerrado brasileiro. É uma espécie frutífera e de uso medicinal, muito utilizada no tratamento de doenças cutâneas, tornando-se alvo do extrativismo predatório. A falta de reposição e a ausência de estudos de conservação e manejo fazem com que a mama-cadela seja afetada, diretamente, pelo extrativismo predatório tendo assim uma diminuição em sua população natural. Diante à falta de informações sobre a genética populacional da espécie os marcadores microssatélites configuram-se como uma ferramenta biotecnológica eficiente e adequada em avaliar o fluxo gênico, dinâmica populacional e dispersão para que assim estratégias de manejo possam ser traçadas. Dessa forma, o presente estudo tem como objetivo promover o desenvolvimento dos primeiros marcadores microssatélites para B. Gaudichaudii. Para isto, foi utilizada uma amostra populacional com 27 indivíduos adultos, sendo utilizado um único acesso de Mama-Cadela para obtenção do DNA genômico. Com isso o DNA foi extraído, quantificado, digerido com endonucleases e ligado a adaptadores; os fragmentos foram pré-amplificados via PCR e purificados para seleção de fragmentos de interesse contendo microssatélites por hibridação; os fragmentos selecionados foram ligados ao vetor de clonagem e por eletroporação foram inseridos em células competentes de E. coli; por fim, as células transformadas foram repicadas em meio LB sólido para crescimento e selecionados os clones positivos para construção da biblioteca genômica. Para obtenção dos primers foram utilizados softwares disponibilizados na internet de forma gratuita. Desse modo, dos 48 clones sequenciados no sentido de ida e volta a partir da biblioteca genômica obtida, produzimos um total de 96 sequencias, das quais 78 foram descartadas no processo de edição por apresentarem baixa qualidade, as dezoito sequências restantes foram analisadas e encontramos 10 SSRs. Do total de 10 sequências contendo microssatélites apenas seis foram apropriadas para o desenho dos primers. Portanto, o presente estudo descreve os seis primeiros loci de microssatélites para a espécie em questão.
Abstract: The species Brosimum gaudichaudii belongs to the Moraceae family and is widely distributed in the Brazilian Cerrado. It is a fruitful and medicinal species, widely used in the treatment of diseases, not becoming a target of predatory extractivism. The lack and absence of conservation and management studies make it predatory, directly, by extractivism, thus increasing its natural population. to the lack of information on the population genetics of the species of microsatellite indicators configured as an efficient biotechnological tool and in evaluating the genetic flow, population and dispersion so that the management tools are adequate to be traced. Thus, the present study aims to promote the development of the first microsatellite markers for B. Gaudichaudii. For this, 27 accessions from a population of adults were used, using a single Mama-Cadela sample to support the DNA. With that, the DNA was extracted, quantified, digested with endonucleases and ligated to adapters; the fragments were pre-amplified via PCR and purified for selection of fragments of interest containing microsatellites by hybridization; the selected fragments were ligated to the cloning vector and by electroporation they were inserted into competent E. coli cells; finally, the transformed cells were half-pickled in solid LB for growth and the original clones were selected for construction of the genomic library. For supplies used, the software available on the internet was used free of charge. Thus, of which 78 clones sequenced in the round-trip direction from the genomic library48, a total of 96 sequences were produced, of which 78 were discarded in the editing process due to low quality, as from the 18 remaining sequences were found and 10 remaining sequences SSRs. Of the total of 10 sequences containing microsatellites, only six were suitable for the design of the primers. Therefore, the present study describes the first six microsatellite sites for the species in question.
Palavras-chave: Mama- Cadela
Marcadores de DNA
Primers de Microssatélites
Bioma Cerrado
Área do CNPq: CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
Idioma: por
Pais: Brasil
Editor: Instituto Federal Goiano
Sigla da Instituição: IF Goiano
Campus: Campus Urutaí
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
URI: https://repositorio.ifgoiano.edu.br/handle/prefix/2384
Data do documento: 17-Ago-2021
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