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metadata.dc.type: Dissertação
Title: DESENVOLVIMENTO E CARACTERIZAÇÃO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES PARA REGIÕES ALVOS DE RESISTÊNCIA À Meloidogyne ssp. em Phaseolus vulgaris
Other Titles: Development and characterization of microsatellite markers for target regions of resistance to Meloidogyne ssp. in Phaseolus vulgaris
metadata.dc.creator: Carvalho, Solange Aline de
metadata.dc.contributor.advisor1: Menezes, Ivandilson Pessoa Pinto de
metadata.dc.contributor.referee1: Menezes, Ivandilson Pessoa Pinto de
metadata.dc.contributor.referee2: Barbosa, Ana Clara de Oliveira Ferraz
metadata.dc.contributor.referee3: Arruda, Alcione da Silva
metadata.dc.description.resumo: O uso de marcadores moleculares tem crescido exponencialmente nos últimos anos, principalmente em estudos de genética de populações de plantas, quando se trata da conservação de espécies importantes ou que estão inseridas em biomas que precisam ser preservados. A exemplo disso, tem-se a cultura do feijão (Phaseolus vulgaris) cultivado no bioma Cerrado, sendo exposto a diferentes tipos de solos, climas e patógenos. Dentre os patógenos radiculares, os nematoides de galha se destacam, sendo considerados pragas do feijoeiro. Diante disso, o objetivo foi desenvolver e caracterizar marcadores microssatélites que confiram resistência ao nematoide Meloidogyne spp. em feijão comum. Para isso, sequências de QTLs foram selecionadas no banco de dados NCBI, por apresentarem genes homólogos aos da soja por possuírem resistência ao patógeno em questão, sendo identificadas para o feijão, usando o programa “BLAST” no site Phytozome. Nove primers foram desenhados utilizando o programa Primer3. Foi feita a extração de DNA de sementes de feijão comum, utilizando protocolo de extração pelo método SDS 10%. A quantificação foi feita em eletroforese em gel de agarose a 1,2%, corado com brometo de etídeo (0,5%/ml) em solução tampão (TBE) 1x. Para amplificação e otimização por PCR, o DNA de um único genótipo foi usado, utilizando termociclador. As PCRs funcionais foram submetidas à eletroforese vertical em géis de poliacrilamida (4%) e corados com nitrato de prata. A transferibilidade permite aumentar a eficiência na transferência de informação genômica através da homologia de EST de genes de interesse. Nove de 26 EST-SSR candidatos em feijão distribuídos em sete diferentes genes que conferem resistência a nematoide de galha em soja estão disponíveis para validação.
Abstract: The use of molecular markers has grown exponentially in recent years, especially in studies of plant populations genetics, when it comes to the conservation of important species or that are inserted in biomes that need to be preserved. As an example, we have the bean (Phaseolus vulgaris) cultivated in the Cerrado biome, being exposed to different types of soils, climates and pathogens. Among the root pathogens, the gill nematodes stand out, being considered pest of the common bean. Therefore, the target was develop and characterize microsatellite markers that confer resistance to the nematode Meloidogyne spp. in common beans. For this, QTL sequences were selected in the NCBI database because they presented genes homologous to those of soybeans because they had resistance to the pathogen in question and were identified for the bean using the BLAST program at Phytozome. Nine primers were designed using the Primer3 software. The DNA extraction of common bean seeds was done using a 10% SDS extraction protocol. Quantification was performed on 0.8% agarose gel electrophoresis, stained with ethidium bromide (0.5%/ml) in 1x buffer solution (TBE). For amplification and PCR optimization, the DNA of a single genotype was used, using thermocycler. Functional PCRs were submitted to vertical electrophoresis in polyacrylamide gels (4%) and stained with silver nitrate. Transferability allows to increase the efficiency in the transfer of genomic information through EST homology of genes of interest. Nine of 26 EST-SSR bean candidates distributed in seven different genes conferring nematode resistance to gall in soya are available for validation.
Keywords: Marcadores de DNA
Seleção Assistida
Resistência Genética
metadata.dc.subject.cnpq: CIENCIAS BIOLOGICAS
metadata.dc.language: por
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Instituto Federal Goiano
metadata.dc.publisher.initials: IF Goiano
metadata.dc.publisher.department: Campus Urutaí
metadata.dc.publisher.program: Programa de Pós-Graduação em Conservação de Recursos Naturais do Cerrado
metadata.dc.rights: Acesso Aberto
URI: https://repositorio.ifgoiano.edu.br/handle/prefix/207
Issue Date: 26-Mar-2018
Appears in Collections:Mestrado Profissional em Conservação dos Recursos Naturais do Cerrado

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